Un poco de teoría (pero no cuantica XDDD)

Voy a explicar la diferencia entre los paquetes RPM y los paquetes DEB.

Empiezo por los primeros,

RPM (llamado Red Hat Package Manager), es una herramienta de administración de paquetes pensada básicamente para Linux. Es capaz de instalar, actualizar, desinstalar, verificar y solicitar programas. RPM es el formato de paquete de partida del Linux Standard Base.
Originalmente desarrollado por Red Hat para Red Hat Linux, en la actualidad muchas distribuciones Linux lo usan dentro de los cuales las más destacadas son Fedora Linux, MandrivaLinux, SuSE Linux y Conectiva Linux. También se ha portado a otros sistemas operativos.

DEB es la extensión del formato de paquetes de software de Debian, y el nombre más usado para dichos paquetes. Como Debian, su nombre proviene de Deborah Murdock, esposa del fundador Ian Murdock.
El programa predeterminado para manejar estos paquetes es dpkg, generalmente via el sistema APT.
Los paquetes deb también pueden ser convertidos a otros formatos de paquetes usando la aplicación Alien, y viceversa. Los paquetes DEB también lo utilizan otras distros basadas en Debian, como puede ser Ubuntu.